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미지 대사물질 식별

대사체학에서는 일반적으로 네 가지 차원에 따라 대사물질 식별의 신뢰도를 구분합니다: 신뢰할 수 있는 식별로 얻어진 화합물(1급), 가정된 주석으로 얻어진 화합물(2급), 가정된 주석으로 화합물 범주를 식별한 것(3급), 그리고 미지의 화합물(4급). 1급 식별은 목표 대사물질의 두 개 이상의 직교 특성(예: 보유 시간, m/z 및 파편 질량 스펙트럼)을 동일한 분석 조건에서 관찰된 실제 화학 표준품의 동일한 특성과 비교해야 합니다. 추정(2급 또는 3급) 주석은 기본적으로 하나 또는 두 개의 특성에만 의존하며, 일반적으로 서로 다른 실험실에서 수집한 데이터 및 다른 분석 방법으로 얻은 데이터의 비교에 기반합니다. 이는 동일한 분석 조건에서 실제 화학 표준품과의 직접 비교가 아닙니다.

미지의 대사물질은 반복적으로 감지되지만 그 화학적 정체성이 아직 확립되지 않은 작은 분자를 나타냅니다. 이러한 화합물은 아직 식별 및 분류되지 않았더라도 대사체학 실험에서 스펙트럼 데이터를 기반으로 구분하고 정량화할 수 있습니다. LC-MS 실험에서 미지의 화합물은 고유한 보유 시간, 하나 이상의 질량 또는 특정 1차 이온 파편 패턴으로 정의됩니다. NMR 실험에서는 화학적 이동 패턴으로 정의됩니다. 미지의 물질은 이전에 식별되지 않은 작은 분자, 예를 들어 대사의 2차 산물 또는 희귀한 외인성 물질을 나타낼 수 있으며, 또는 기존의 NMR 참고 스펙트럼이나 MS 파편 패턴에 할당할 수 없는 기존 경로의 분자가 될 수 있습니다.

미지 화합물의 식별은 매우 시간이 많이 소요되고 비용이 많이 들며 일반적으로 NMR 연구를 위해 준비 규모의 분리를 수행하거나 MS/MS를 사용한 구조 비교를 위해 대량의 화학 합성이 필요합니다. 따라서 대부분의 보고서는 상용 표준품이 사용 가능하거나 대사물질 데이터베이스에 존재하는 대사물질, 즉 1급, 2급 및 3급으로 분류된 대사물질의 검출에 중점을 둡니다. 많은 대사물질의 고유한 불안정성과 수요의 부족으로 인해, 상업적으로 이용 가능한 분석 표준품은 수천 종에 불과합니다. 그러나 이러한 표준품과 데이터베이스에 존재하는 대사물질은 내인성 대사물질의 매우 작은 부분에 지나지 않습니다. 따라서 대사체학 연구에 있어서 비특징적 대사물질을 정렬, 연구 및 궁극적으로 식별할 효과적인 방법이 매우 중요합니다. 미지의 대사물질의 성공적인 식별은 바이오마커 발견과 오믹스 연구에 큰 영향을 미칠 것입니다.

미지의 대사물질 식별

대사체학 샘플에서 미지의 화합물을 식별하기 위해서는, 같은 식별 가능한 공칭 질량을 가지는 대사물질, 같은 식별 가능한 공칭 질량을 가지지만 분자식과 동위원소 질량이 다른 것, 같은 식별 가능한 공칭 질량과 동위원소 질량을 가지지만 화학 구조가 다른 것을 구분해야 합니다. 예를 들어, 류신과 아이소류신은 구조가 다른 이성질체이지만 식별 가능한 공칭 질량과 동위원소 질량이 동일합니다. 또한 단일 대사물질은 질량 분석기에서 다양한 유도체로 감지될 수 있으므로, 다른 유도체를 모체 대사물질에 올바르게 할당하는 것도 중요합니다. 예를 들어, 아미노산 분석에서 트리메틸실레인화(TMS)는 아미노산과의 화학적 유도 반응을 수행하여 1, 2 또는 3개의 TMS 그룹을 포함하는 아미노산을 생성합니다. 이러한 아미노산은 모두 동일한 모체 아미노산에 속해야 합니다.

바이오파크 바이오테크놀로지는 NMR, LC-MS/MS 및 생물정보학 분석법을 결합하여, 질량 분석 기반의 미지 대사물질 식별 분석 서비스를 제공하며, 복잡한 생물 샘플 내의 대사물질을 정확하게 식별할 수 있습니다. 바이오파크 바이오테크놀로지는 도구와 데이터베이스를 지속적으로 개발하여 모든 대사물질을 자동화된 방식으로 진정하고 완전하게 식별할 수 있기를 기대합니다. 상담을 환영합니다!

미지 대사물질 식별

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