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4D 단백질체학

질량 분석 단백질체학의 기본 원리는 시료 이온의 물리화학적 특성을 측정하여 분석하는 것입니다. 시료의 질량 스펙트럼 및 관련 정보를 바탕으로 정성 및 정량 결과를 얻습니다. 현재, 단백질체학 질량 분석은 일반적으로 보유 시간(retention time), 질량 대 전하 비(m/z), 이온 강도(intensity) 이 세 가지 차원을 기반으로 펩타이드 단백질을 식별하고 정량화합니다. 즉, 3D 단백질체학입니다. 4D 단백질체학은 3D 단백질체학에 네 번째 차원인 이온 이동도(mobility)를 추가하여, 이온의 형태와 단면에 따라 이온을 분리합니다. 이는 m/z 차이가 매우 작은 펩타이드를 구분할 수 있어 저농도 단백질 신호를 식별할 수 있습니다. 4D 단백질체학은 timsTOF Pro 질량 분석기를 기반으로 하며, PASEF(병렬 축적 연속 파편화) 및 TIMS(트랩 이온 이동 스펙트럼)를 결합하여 모든 검출 이온의 충돌 단면(CCS)을 반복적으로 측정할 수 있습니다. 이를 통해 더 빠르고 민감하게 단백질체 정성 및 정량 분석을 수행할 수 있습니다.

Meier, F. et al. Mol Cell Proteomics. 2018.

4D 단백질체학

바이오텍 파크 생명공학은 timsTOF Pro 기반의 4D 단백질체학 연구 서비스를 제공하여 미량 샘플 단백질체학, 대량 샘플군 의학 및 고처리량 수정체학 등 연구 작업을 지원합니다.

샘플에 관하여

1. 만약 co-IP 샘플을 제공하는 경우, 단백질은 약 2-5ug 필요하며, 단백질 샘플에는 세제(예: SDS) 및 높은 산소 농도가 포함되지 않도록 해야 합니다. 또는 단백질 샘플이 포함된 구슬(beads)을 직접 보내주시면 후속 실험을 저희가 담당합니다.
2. 조직 샘플을 제공하는 경우, 드라이아이스를 사용하여 조직 샘플을 보내주십시오. 동물 샘플은 200mg 이상, 혈액 샘플은 최소 1ml(혈장은 EDTA 방부제를 사용), 혈청은 0.2-0.5ml, 소변은 2ml, 식물 샘플은 최소 1g, 세포 샘플은 1X10^7 개의 세포, 효모 및 미생물 등은 건조 중량 200mg 이상입니다.
3. 단백질 샘플을 제공하는 경우, 단백질 총량이 50ug 이상이어야 합니다. 단백질 추출 시 일반적인 조직, 세포 용해액을 사용하십시오.
4. 샘플 운송: 충분한 드라이아이스를 사용하여 운송하고, 가능한 빠른 배송 방법을 선택하여 운송 중 샘플의 분해 가능성을 줄이십시오.

중/영문 프로젝트 보고서

기술 보고서에서 바이오텍 파크는 상세한 중/영문 이중 언어 기술 보고서를 제공하며, 보고서에는 다음이 포함됩니다:

1. 실험 절차 (중/영문)
2. 관련 실험 매개변수 (중/영문)
3. 질량 스펙트럼 이미지
4. 원시 데이터
5. 단백질체학 분석 결과