단백질 질량 분석 식별

단일 단백질 또는 단백질 혼합물의 단백질 스펙트럼 식별/분석, 그리고 단일 단백질의 단백질 서열 분석은 생물학 연구에서 자주 직면하는 문제입니다. 질량 분석법에 기반하여 단백질 서열 정보를 얻고, 질량 분석법을 통해 단백질 질량 분석 식별을 수행하며, 단백질 스펙트럼 분석을 통해 단백질 식별을 실현합니다. 즉 protein identification은 LC-MS 기반의 단백질 스펙트럼 식별을 의미합니다. 일반적인 분석에는 다음이 포함됩니다.질량 분석을 통한 단백질 분자량 측정，단백질의 N말단 및 C말단 서열 분석，단백질 서열 분석 및，번역 후 수정 위치 분석 등。

Baitai Park Biotechnology는 Thermo의 최신 Obitrap Fusion Lumos 질량 분석기를 사용하여 Nano-LC 나노 리터 크로마토그래피 기술과 결합하여 단백질 추출물, SDS-PAGE 단백질 밴드, 2D 단백질 젤 점, 풀다운 및 Co-IP 등의 샘플에서 단백질을 효율적이고 정확하게 식별합니다.

Baitai Park는 다음과 같은 단백질 질량 분석 식별 서비스를 제공합니다.

1. 정제된 단백질에 대해 단백질 질량 분석/식별을 수행합니다.
2. 단백질 젤 점, 단백질 젤 스트립 질량 분석 식별, 단백질 은염색 젤 질량 분석 식별, 고염색/형광/Zn/Cu2+ 등의 유형의 염색된 젤 점/젤 스트립 샘플을 식별합니다. 참고 가능:단백질 젤 점, 젤 스트립, IP 샘플 단백질 식별 서비스；
3. 풀다운 단백질 질량 분석 식별, IP 단백질 상호작용의 IP-MS 상호작용 단백질 식별, Co-IP 질량 분석 검증 상호작용 단백질, 면역 공동 침전에 기반한 질량 분석 검증 등 간단한 혼합물 샘플의 단백질 샘플에 대해 단백질 식별/분석을 수행합니다.
4. 복잡한 샘플에서 미지의 단백질에 대해 단백질 질량 분석/식별을 수행합니다. 매우 낮은 농도의 단백질 샘플이라도 단백질 질량 분석 식별을 통해 식별될 수 있습니다.

단일 단백질과 간단한 단백질 혼합물의 식별에 대해서는 100% 식별률을 보장하며, 그렇지 않으면 비용을 청구하지 않습니다.

NanoLC-MS/MS 분석은 간단하거나 복잡한 혼합물에서 단백질 질량 분석을 수행합니다. 샘플은 SDS-PAGE 젤의 밴드 또는 단백질 점에서 가져올 수 있으며, 용액 샘플일 수도 있습니다.(당사는 1D 또는 2D SDS-PAGE 서비스도 제공합니다. 자세한 내용을 보려면 클릭하십시오.)

Baitai Park의 질량 분석 기반 단백질 식별 예시

Baitai Park의 질량 분석 기반 단백질 질량 분석 식별 절차:

샘플 전처리
우선, 디티오트레오리톨(DTT)로 단백질 샘플을 환원하고, 요오드아세트아미드(IAA)로 알킬화합니다. 그런 다음 트립신을 사용하여 샘플을 소화하며, 일반적으로 샘플은 라이신과 아르기닌 잔기 후에 절단됩니다. 마지막으로, 동결 건조하여 펩타이드 조각을 얻습니다.

기기 분석
샘플을 NanoLC의 A상으로 다시 용해한 후 로딩하고, NanoLC-MS/MS 시스템에서 분석합니다.

데이터베이스 검색
샘플의 생물종 출처에 따라 UniProt에서 해당 생물종의 단백질 데이터베이스를 다운로드하고, MaxQuant, Proteome Discoverer, Peaks 등의 소프트웨어를 사용하여 액체 크로마토그래피-질량 분석기로 얻은 데이터를 데이터베이스의 데이터와 매칭시켜, 펩타이드의 1차 및 2차 조각의 질량을 통해 데이터베이스에서 매칭된 단백질을 찾아 샘플 내 단백질을 식별합니다.

샘플의 생물종에 완전한 단백질 데이터베이스가 없는 경우, 친연성이 높은 생물종의 단백질 데이터베이스 또는 동일한 모델 생물의 단백질 데이터베이스를 사용하여 단백질 식별 분석을 수행합니다.

보고서 발행
식별 보고서에는 샘플 전처리 단계, 크로마토그래피-질량 분석 플랫폼 매개변수, 식별된 단백질 목록 및 펩타이드 목록이 포함됩니다. 질량 분석 원시 데이터는 클라우드 드라이브 형태로 제공됩니다.

샘플을 수집하여 우리에게 제공하기만 하면, 이후 모든 단계는 우리가 완료합니다.Baitai Park의 질량 분석 기반 단백질 질량 분석/분석 서비스는 다음을 포함합니다: 샘플 전처리 - 단백질 환원 알킬화 후 고특이성 단백질 가수분해효소를 사용하여 단백질 샘플을 소화하여 펩타이드 조각을 얻습니다; 기기 분석 - 나노 플로우 크로마토그래피와 고해상도 질량 분석기를 결합하여 최대 민감도로 펩타이드를 분리하고 초고해상도 질량 분석기로 펩타이드 질량 데이터를 수집합니다; 데이터베이스 검색 - 샘플 생물종에 해당하는 단백질 데이터베이스를 결합하여 수천 장의 질량 스펙트럼을 분석합니다 (Uniprot 데이터베이스를 사용하며, 매월 데이터베이스를 업데이트하여 최신 데이터를 보장합니다), 이를 통해 샘플 내 단백질의 질량 분석 식별을 실현합니다; 마지막으로 샘플 보고서를 발행하는 모든 과정을 Baitai Park가 원스톱으로 완료합니다.

1. 고객은 하나 이상의 단백질이 포함된 샘플을 제공합니다. 예: 젤 스트립, 젤 밴드, 용액 또는 고체 샘플, 풀다운 또는 Co-IP 샘플.
2. Baitai Park는 샘플 상황에 따라 적절한 효소를 선택하여 제공된 샘플을 단백질 분해 효소로 소화한 후 nanoLC-MS/MS 분석을 수행합니다.
3. 얻은 데이터를 데이터베이스 분석을 통해 검색합니다.
4. 10-15 근무일 내에 보고서를 받게 됩니다.

*샘플에 세제/리세제제가 포함되어 있는 경우, 샘플 제출서에 표시해 주세요.