질량 분석 기반의 서열 분석

질량 분석 기반의 단백질, 항체, 폴리펩타이드 등의 샘플에 대한 서열 분석은 샘플의 아미노산 서열을 분석하는 것입니다. 질량 분석 서열 분석은 질량 분석을 기반으로 샘플의 1차 구조 아미노산 서열을 측정하는 것을 의미합니다. 질량 분석 서열 분석에 들어가기 전에 몇 가지 정의를 간단히 소개하겠습니다. 아미노산은 아민(-NH2) 및 카복실기(-COOH) 관능기와 각 아미노산에 고유한 측쇄(R 그룹)를 포함하는 유기 화합물입니다. 펩타이드는 두 개에서 50개의 아미노산이 펩타이드 결합으로 연결된 짧은 체인입니다. 폴리펩타이드는 더 길고 연속적이며 가지가 없는 펩타이드 체인으로, 약 50개의 아미노산을 포함할 수 있는 더 긴 펩타이드 체인입니다. 50개 이상의 아미노산을 포함하는 폴리펩타이드/펩타이드 체인은 단백질이라고 불립니다. 단백질은 하나 이상의 생물학적 기능 단위로 배열된 폴리펩타이드로 구성되어 있으며, 종종 리간드(예: 보조효소 및 보조인자), 다른 단백질, 다른 대분자(예: DNA 또는 RNA) 또는 더 복잡한 대분자 조립체에 결합할 수 있습니다. 항체(Ab), 면역글로불린(Ig)이라고도 불리는 Y자 모양의 대형 단백질은 주로 형질세포에 의해 생성되어 면역 시스템이 병원체(예: 병원균 및 바이러스)를 중화하는 데 사용됩니다.

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질량 분석 기반 폴리펩타이드 서열 분석

Edman 분해법에 비해 질량 분석법의 장점은 질량 분석법이 더 민감하고 펩타이드를 더 빠르게 절단할 수 있으며, 말단이 막히거나 변형된 단백질 샘플을 식별할 수 있다는 것입니다. 바이타이팩 바이오테크놀로지는 기존의 고해상도 질량 분석 기술 플랫폼을 활용하여 질량 분석 기반의 서열 분석 서비스를 제공하며, 측정된 타깃 단백질 서열의 100%를 커버할 수 있습니다.

 

질량 분석 서열 분석 개념도

단백질 샘플 서열 분석 과정에서는 일반적으로 Trypsin만을 사용하여 단백질을 효소 절단하며, 식별된 펩타이드 단편의 커버리지율은 약 60%입니다. 타깃 단백질의 전체 서열 정보를 얻기 위해, 바이타이팩 바이오테크놀로지는 단백질 서열 분석 과정에서 자주 사용되는 6종의 효소(Trypsin, Chymotrypsin, Asp-N, Glu-C, Lys-C, Lys-N)를 각각 타깃 단백질에 적용하여 효소 절단 및 질량 분석을 수행하고, 단편 펩타이드를 얻음과 동시에 펩타이드 간의 조립을 통해 단백질 서열의 100%를 측정합니다. 바이타이팩은 Thermo사의 최신 Obitrap Fusion Lumos 질량 분석기를 사용하여 단백질 샘플의 서열 분석을 수행하며, Obitrap Fusion Lumos 질량 분석기는 현재 해상도와 민감도가 가장 높은 질량 분석기로, 저농도 펩타이드 단편의 식별 민감도를 보장합니다. 또한 펩타이드 단편화 과정에서 HCD와 ETD 결합 방식을 사용하여 펩타이드 단편의 완전성을 보장합니다. 이는 단백질 샘플의 N말단, C말단 서열 분석, 단백질 전체 서열 분석을 실현할 수 있습니다. 알려지지 않은 이론적 서열의 샘플에 대해서는 디노보(de novo) 서열 분석 방법을 통해 서열 분석을 수행할 수 있습니다.

바이타이팩은 다음과 같은 질량 분석 기반 서열 분석 서비스를 제공합니다: