TPD 약물 표적 성능 단백질 군 분석
생명공학의 급속한 발전과 함께 약물 개발은 점차 정밀하고 개별화된 새로운 시대에 접어들고 있습니다. 표적 단백질 분해(TPD) 약물은 새로운 치료 전략으로, 체내의 유비퀴틴-프로테아좀 시스템을 활용하여 특정 병리 단백질을 분해하여 정밀한 치료를 실현할 수 있습니다. TPD 약물은 중요한 새로운 치료제의 일종으로 점점 더 많은 관심과 혁신을 끌고 있습니다. 특정 질병 타겟(TPD)에 대한 약물 설계는 현재 약물 개발 분야의 핫스팟이 되었습니다.
단백질체학은 생물체 내의 단백질 구성, 구조, 기능 및 상호 관계를 연구하는 과학으로, 약물과 단백질 사이의 상호 작용을 전면적으로 밝힐 수 있습니다. 단백질체학 기술을 결합하여 TPD 약물의 표적 성능을 심층적으로 연구할 수 있으며, 약물의 최적화 설계 및 임상 적용에 중요한 근거를 제공합니다.
바이타이파크 생명공학(BTP)은 Thermo사의 Obitrap Fusion Lumos와 같은 고해상도 질량 분석기를 사용하여 TPD 약물 표적 성능 단백질체 분석 플랫폼을 구축하였으며, 전 단백질체학 기술에 기반한 TPD 약물 표적 분해 특성 분석 서비스를 제공합니다. 한 번의 실험으로 8000-10000종의 전 단백질을 식별할 수 있으며, 제공하는 분석 서비스는 다음을 포함하지만 이에 국한되지 않습니다:
• 표적 단백질 분해 활성(Target protein degradation activity)분석:
비데이터 의존 수집(DIA) 기술과 전문 단백질 탐색 소프트웨어를 사용하여, 전통적인 DDA 기술을 대표하는 TMT/iTRAQ의 라벨링 정량 기술에 비해 단백질체를 더 포괄적으로 커버하며 목표 단백질(POI)의 정량 정확성을 효과적으로 향상시킵니다.
• 표적 선택성(Target selectivity) 분석:
차별 단백질체 분석을 통해 POI 및 기타 차별 단백질 변화를 분석하여 TPD 약물의 표적 선택성을 종합적으로 평가합니다.
• 잠재적 비표적 위험 및 안전성 문제(Potential off-target and safety concerns) 분석:
TPD 약물 표적 선택성 결과를 기반으로, 다중 플랫폼 데이터베이스 분석을 통합하여 TPD 약물의 잠재적 비표적 위험 및 안전성 문제를 탐구합니다.
• 생물학적 기능 및 작용 메커니즘(Biological functions and mechanisms of action) 분석:
고전적인 생물정보학 기능 분석 전략을 사용하여, 예를 들어 PPI, GO 및 KEGG 등을 통해 TPD 약물이 매개하는 생물학적 기능 및 작용 메커니즘을 탐구합니다.
실험 설계 및 과정
• 샘플 준비: 적절한 농도, 시간대 실험 설계;
• 샘플 전처리: 전 단백질 추출, 단백질 절단;
• 질량 분석 수집: DIA 수집, DIANN 탐색;
• 데이터 처리: 자동화 분석 프로세스, 개인화 분석 프로세스.
그림 1. TPD 약물 표적 성능 단백질체 분석 실험 과정
적용 가능한 샘플 유형
• 세포 침전: 각 그룹에 최소 1개의 처리 그룹, 1개의 대조군, 각 그룹당 최소 3개의 샘플 권장;
• 조직 샘플: 각 그룹에 최소 1개의 처리 그룹, 1개의 대조군, 각 그룹당 최소 5개의 샘플 권장.
결과 전달
TPD 약물 표적 성능 단백질체 분석원스톱 서비스
주문-샘플 발송만 하시면 됩니다
바이타이파크 생명공학 원스톱 서비스 완료: 샘플 처리-기기 분석-데이터 분석-프로젝트 보고서
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