차별 발현 단백질의 군집 분석

선택된 차등 발현 단백질 또는 특징 차등 발현 단백질의 합리성과 정확성을 검증하기 위해, 군집 분석을 통해 단백질을 발현량의 추세에 따라 집합할 수 있으며, 보다 직관적인 단백질체 데이터 분석을 실현할 수 있습니다.


1. 계층적 군집 분석

선별된 차등 발현 단백질에 대해 계층적 군집 분석을 수행하여 동일하거나 유사한 발현 패턴을 가진 단백질을 군집화합니다. 차등 발현 단백질 군집 결과는 아래 그림과 같습니다.

그림 1 차등 발현 단백질 계층적 군집도

주: 그림 내 서로 다른 열은 다른 샘플을, 서로 다른 행은 다른 단백질을 나타냅니다. 색상은 샘플 내 단백질의 발현 수준을 나타냅니다.

2. K-means 군집 분석

단백질이 다른 실험 처리에서의 발현 패턴을 연구하기 위해, 샘플의 발현량을 K-means 군집 분석합니다. 동일한 그룹의 단백질은 다른 실험 처리에서 유사한 변화 추세를 가지며, 유사한 변화 추세를 가진 단백질은 유사한 기능을 갖는 경우가 많습니다.

그림 2 차등 발현 단백질 군집 선 그래프

주: x축은 샘플 그룹을, y축은 발현량을 나타냅니다. 검은 선은 이 클러스터 내 모든 단백질의 다른 실험 조건에서의 상대 발현량 평균값의 선 그래프를 나타냅니다.