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다양한 샘플 유형이 엑소좀 정제 효율에 미치는 영향은 무엇인가요? (혈청, 혈장, 소변, 타액)

엑소좀(exosomes)은 세포 간 통신의 중요한 매개체로서, 암 조기 선별, 질병 진단, 약물 전달 등 분야에서 잠재력을 가지고 있어 널리 주목받고 있습니다. 엑소좀은 혈청, 혈장, 소변, 타액 등 다양한 체액에 널리 존재하며 액체 생검에 이상적인 샘플 원천을 제공합니다. 그러나 다양한 유형의 샘플은 엑소좀의 함량, 배경 간섭 및 추출 난이도에서 현저한 차이를 보여 엑소좀 정제 효율성과 하류의 오믹스 분석 품질에 직접적인 영향을 미칩니다.

1. 다양한 체액이 엑소좀 정제 효율성에 미치는 영향

1. 혈청(Serum): 높은 단백질 배경, 잡음 제거 필요

(1) 장점: 혈청의 출처가 다양하고 조작이 간편하며 엑소좀 농도가 높아 수집이 용이합니다.

(2) 도전과제: 혈청은 응고 과정에서 다수의 혈소판 유래 엑소좀을 방출하고 알부민, 면역글로불린 등 고농도의 단백질이 풍부하여 정제 및 후속 단백질 오믹스 분석에 방해가 됩니다.

(3) 추출 효율: 중고, 약 1–3 × 10⁹ particles/mL

(4) 권장 전략:

  • 밀도 구배 원심분리 또는 크기 배제 크로마토그래피(SEC)를 사용하여 순도를 높입니다.
  • 단백질 분해 효소 전처리 또는 고분자 중합체 침전 + SEC 결합 방법을 사용하여 엑소좀 정제 효과를 높입니다.

2. 혈장(Plasma): 항응고제가 엑소좀 정제 효과에 영향을 미칩니다.

(1) 장점: 혈장 내 엑소좀은 생리적 상태에 더 가까우며 응고 간섭을 받지 않습니다.

(2) 도전과제: 일반적인 항응고제(EDTA, 헤파린, 시트르산 나트륨 등)는 엑소좀 막 단백질과 결합하여 입자 구조 또는 하류 검출에 영향을 미칠 수 있습니다.

(3) 추출 효율: 중간, 약 1–2 × 10⁹ particles/mL

(4) 권장 전략:

  • EDTA 항응고 혈장을 선택하여 헤파린 간섭을 피합니다.
  • 추출 전에 항응고제 잔류 처리 가능
  • 마찬가지로 SEC 결합 차속 원심분리 방법을 추천합니다.

동일한 주제에서 샘플 일관성을 유지할 것을 권장합니다(예: 혈청 또는 혈장 통일 사용). 샘플 기질 차이로 인한 배치 편차를 피합니다.

3. 소변(Urine): 낮은 배경, 낮은 농도, miRNA 연구에 적합

(1) 장점: 비침습적이고 수집이 용이하며 배경 단백질이 낮아 miRNA, circRNA 등 비암호화 RNA 분석에 적합합니다.

(2) 도전과제: 엑소좀 농도가 낮으며 물 섭취량, 신장 기능의 변동이 큽니다. 소변 pH, 염이온, 단백질 분해 효소 활성 등이 엑소좀 안정성에 영향을 미칩니다.

(3) 추출 효율: 낮음, 약 0.1–0.5 × 10⁹ particles/mL

(4) 권장 전략:

  • 아침 소변을 수집하여 원시 샘플의 1/10 이상으로 농축합니다.
  • 초여과와 SEC 방식을 결합하여 추출할 것을 권장합니다.
  • 단백질 분해 효소 억제제를 추가하고 pH를 조절해야 합니다.

4. 타액(Saliva): 높은 점도, 높은 배경

(1) 장점: 비침습적이며 반복 채취가 가능하고 독특한 진단적 가치를 가지고 있습니다(구강암, 신경계 질환 등).

(2) 도전과제: 점액소, 아밀레이스 등 오염이 심하며 다수의 구강 미생물 유래 소포가 존재하여 특이성에 영향을 미칩니다.

(3) 추출 효율: 중간 편 낮음, 약 0.2–1 × 10⁹ particles/mL

(4) 권장 전략:

  • 전처리에 점액 분해 효소, 단백질 분해 효소 억제제 추가
  • 필터링 후 세균을 제거한 후 원심분리/SEC를 수행합니다.
  • CD9/CD63 등 마커를 웨스턴 블롯으로 검증하여 출처의 신뢰성을 확보할 것을 권장합니다.

2. 다양한 샘플 선택 권장사항 및 응용 장면 비교

샘플 유형 엑소좀 농도 배경 단백질 적용 연구 방향
혈청 높음 높음 암 마커, 대사 질환
혈장 중간 중고 심혈관 질환, 면역 연구
소변 낮음 낮음 비뇨기계 질환, RNA 유전체학
타액 중간 이하 높음 신경계, 구강 질환

   
3. 엑소좀 정제 효율 향상을 위한 전체적인 최적화 생각

1. 적합한 샘플 유형 선택: 연구 목표(예: 단백질 군 vs miRNA)에 따라 엑소좀 함량이 높고 배경이 적은 체액을 선택해야 합니다.

2. 추출 전략 최적화: SEC와 차속 원심분리 또는 상업용 키트 + 정제 칼럼 결합 프로세스를 사용하여 엑소좀 정제의 순도와 수율을 높이는 것이 좋습니다.

3. 품질 검증을 무시할 수 없습니다: NTA 입자 크기 분석, TEM 형태학, Western blot 표지자 등 다양한 방법을 통해 엑소좀 품질을 종합적으로 평가해야 합니다.

4. 표준화된 프로세스를 통해 데이터 일관성을 높입니다: 인위적인 배치 차이를 피하고 연구 데이터의 신뢰성과 발표 가능성을 높입니다.

엑소좀 연구는 탐색적 연구에서 임상 전환 응용 단계로 나아가고 있습니다. 이 과정에서 샘플 유형의 합리적 선택과 효율적인 엑소좀 정제 전략이 중요한 출발점입니다. 백태파크 생명과학에서는 샘플 전처리, 엑소좀 정제부터 하위 단백질 유전체학, RNA 유전체학 및 대사 유전체학 연계 분석에 이르기까지 원스톱 서비스를 제공하여 연구자들이 엑소좀 연구를 효율적으로 수행할 수 있도록 지원합니다. 체액 속 '나노 보물'을 함께 발굴하기 위해 저희에게 연락해 주세요.

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