ATAC-seq 시퀀싱 원리(염색질 접근성)

ATAC-seq(염색체 접근성 분석을 위한 전이효소를 이용한 시퀀싱)은 염색질 열린 영역(즉, 전사 인자 및 기타 단백질이 결합하기 쉬운 DNA 영역)을 연구하는 데 사용되는 기술입니다. ATAC-seq는 Tn5 전이효소라는 단백질을 사용하여 활성 염색질 영역에 시퀀싱 어댑터를 삽입합니다. 전이효소의 작용은 DNA 절단을 유도하여 길이가 다양한 DNA 조각을 생성합니다. 이러한 조각은 염색질의 열린 상태를 반영하며, 단단히 감긴 DNA 영역은 전이효소에 접근할 수 없습니다. 시퀀싱 어댑터가 삽입된 DNA 조각은 이후 PCR 방법으로 증폭되며, 고속 시퀀싱이 수행됩니다. 시퀀싱 데이터를 분석함으로써 특정 조건에서 어떤 염색질 영역이 열려 있는지를 밝힐 수 있습니다. ATAC-seq의 장점은 전체 유전체 범위에서 염색질의 열린 상태를 빠르고 민감하게 감지할 수 있다는 점으로, 유전자 발현 조절 및 세포 유형 특이성의 후성유전학적 특징을 이해하는 데 매우 유용합니다.

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