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완전한 단일 세포 분석 일반 흐름 - 품질 관리

단일 세포 분석은 유전자 발현, 단백질 활동 또는 기타 생체 분자를 단일 세포 수준에서 연구하는 기술을 의미합니다. 이 분석 방법은 세포 이질성과 개별 세포 간의 미세한 차이를 밝혀낼 수 있습니다. 단일 세포 분석의 일반적인 과정은 다음과 같습니다.


1. 샘플 준비

먼저 조직 해리 또는 유세포 분석 등의 방법을 통해 단일 세포 현탁액을 얻어야 합니다.


2. 단일 세포 포획 및 역전사

미세유체 칩, 형광 활성화 세포 분류(FACS) 또는 미세방울 기술 등을 사용하여 단일 세포를 포획하고, 세포 내 mRNA를 cDNA로 전사합니다.


3. 라이브러리 구축 및 시퀀싱

cDNA를 이용하여 라이브러리를 구축한 후, 고속 대량 시퀀싱을 수행합니다.


4. 품질 관리(QC)

  • 세포 품질 관리: 세포 크기, 형태, 포획 완전성 등의 지표를 통해 죽은 세포나 손상된 세포를 배제합니다.
  • RNA 품질 관리: RNA의 완전성과 농도를 평가하여 mRNA의 품질이 후속 단계에 적합한지 확인합니다.
  • 시퀀스 품질 관리: 소프트웨어 도구를 통해 시퀀싱 데이터의 품질을 검사하고, 저품질 리드, 어댑터 시퀀스 및 오염 물질을 제거합니다.
  • 데이터 품질 관리: 이배체 세포, 빈 드롭(세포가 포획되지 않은 미세방울) 또는 기술적 원인으로 인해 발현량이 너무 낮은 유전자를 제거합니다.

5. 데이터 분석

생물 정보학 도구를 사용하여 데이터 정규화, 세포 유형 식별, 유전자 발현량 분석 등을 수행합니다.


6. 검증 및 해석

관심 있는 세포 아군 또는 유전자 발현 패턴을 실험적으로 검증합니다. 예를 들어 유세포 분석, 면역 형광 표지 등을 사용합니다.


각 단계는 최종 결과의 정확성과 재현성을 보장하기 위해 엄격한 품질 관리가 필요합니다. 특히 QC 단계에서는 세포 품질, RNA 품질 및 시퀀스 품질의 관리가 중요하며, 이는 데이터 분석의 정확성에 직접적인 영향을 미칩니다.


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