완전한 단일 세포 분석 일반 흐름 - 품질 관리
단일 세포 분석은 유전자 발현, 단백질 활동 또는 기타 생체 분자를 단일 세포 수준에서 연구하는 기술을 의미합니다. 이 분석 방법은 세포 이질성과 개별 세포 간의 미세한 차이를 밝혀낼 수 있습니다. 단일 세포 분석의 일반적인 과정은 다음과 같습니다.
1. 샘플 준비:
먼저 조직 해리 또는 유세포 분석 등의 방법을 통해 단일 세포 현탁액을 얻어야 합니다.
2. 단일 세포 포획 및 역전사:
미세유체 칩, 형광 활성화 세포 분류(FACS) 또는 미세방울 기술 등을 사용하여 단일 세포를 포획하고, 세포 내 mRNA를 cDNA로 전사합니다.
3. 라이브러리 구축 및 시퀀싱:
cDNA를 이용하여 라이브러리를 구축한 후, 고속 대량 시퀀싱을 수행합니다.
4. 품질 관리(QC):
- 세포 품질 관리: 세포 크기, 형태, 포획 완전성 등의 지표를 통해 죽은 세포나 손상된 세포를 배제합니다.
- RNA 품질 관리: RNA의 완전성과 농도를 평가하여 mRNA의 품질이 후속 단계에 적합한지 확인합니다.
- 시퀀스 품질 관리: 소프트웨어 도구를 통해 시퀀싱 데이터의 품질을 검사하고, 저품질 리드, 어댑터 시퀀스 및 오염 물질을 제거합니다.
- 데이터 품질 관리: 이배체 세포, 빈 드롭(세포가 포획되지 않은 미세방울) 또는 기술적 원인으로 인해 발현량이 너무 낮은 유전자를 제거합니다.
5. 데이터 분석:
생물 정보학 도구를 사용하여 데이터 정규화, 세포 유형 식별, 유전자 발현량 분석 등을 수행합니다.
6. 검증 및 해석:
관심 있는 세포 아군 또는 유전자 발현 패턴을 실험적으로 검증합니다. 예를 들어 유세포 분석, 면역 형광 표지 등을 사용합니다.
각 단계는 최종 결과의 정확성과 재현성을 보장하기 위해 엄격한 품질 관리가 필요합니다. 특히 QC 단계에서는 세포 품질, RNA 품질 및 시퀀스 품질의 관리가 중요하며, 이는 데이터 분석의 정확성에 직접적인 영향을 미칩니다.
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