펩타이드 서열 분석
이미 확인된 천연 펩타이드는 수천 가지가 있으며, 이들은 인간 생리 과정에서 호르몬, 신경전달물질, 성장 인자, 이온 채널 리간드 또는 감염 방지 등 중요한 역할을 합니다. 펩타이드 약물은 높은 선택성과 효능을 가진 것으로 여겨지며, 상대적으로 안전하고 잘 견디는 특성을 가지고 있습니다. 따라서 펩타이드 약물에 대한 연구 및 개발(R&D)에 대한 관심이 점점 더 커지고 있으며, 수백 가지 펩타이드 약물이 임상 시험 평가를 받고 있습니다.
펩타이드와 단백질은 모두 인체의 기본 구성 요소인 아미노산으로 구성되며, 펩타이드 결합으로 연결됩니다. 그 차이점은 펩타이드가 단백질보다 작은 아미노산 사슬로 구성되어 있다는 것입니다. 펩타이드는 두 개 이상의 아미노산을 포함할 수 있으며, 소수 펩타이드와 다수 펩타이드로 구분됩니다. 소수 펩타이드는 적은 양의 아미노산(약 2-20개)을 포함하고, 다수 펩타이드는 더 많은 아미노산을 포함합니다. 그러나 이 정의와 과학자들이 각 용어를 사용하는 방식은 항상 엄격하지는 않습니다. 단백질은 하나 이상의 펩타이드가 연결되어 형성되므로, 본질적으로 매우 큰 펩타이드입니다. 일반적으로 우리는 아미노산의 수를 기준으로 펩타이드와 단백질을 구분하며, 펩타이드는 2에서 50개의 아미노산으로 구성되고, 단백질은 50개 이상의 아미노산으로 구성됩니다. 펩타이드 약물 연구는 새로운 펩타이드의 발견, 보다 타겟팅된 펩타이드 라이브러리 및 서열 최적화 설계, 새로운 제형 개발, 다기능 펩타이드 및 복합체 개발 등과 같은 엄청난 잠재력을 가지고 있습니다. 이를 실현하기 위해서는 펩타이드 식별 및 펩타이드 서열 분석이 연구를 추진하기 위한 첫 번째 단계입니다.
펩타이드 시퀀싱 다이어그램
질량 분석 기반 펩타이드 서열 분석
펩타이드의 서열 결정에는 일반적으로 두 가지 방법이 있습니다: 데이터베이스 검색 및 de novo 시퀀싱 방법. 30개 이하의 아미노산으로 구성된 짧은 펩타이드의 경우, 바이오텍 팩은 2차 파쇄 방법을 사용하여 질량 스펙트럼 원시 데이터를 얻고, 데이터베이스 검색 또는 de novo 시퀀싱 방법을 통해 이론적 서열을 얻습니다. 30개 이상의 아미노산으로 구성된 긴 펩타이드의 경우, 바이오텍 팩은 3가지 단백질 분해 효소를 사용하여 타겟 펩타이드를 효소 절단하고 식별합니다. 분해 펩타이드 조각을 얻은 후, 펩타이드 조각들 간의 결합을 통해 펩타이드 서열의 100%를 결정하며, 이는 de novo 시퀀싱 방법을 통해 수행됩니다. 일부 펩타이드 혼합물도 위의 방법을 기반으로 서열 분석을 할 수 있습니다.
바이오텍 팩은 Thermo사의 최신 Obitrap Fusion Lumos 질량 분석기와 Nano-LC 나노 유체 크로마토그래피 기술을 사용하여 질량 분석 기반 펩타이드 서열 분석 및 펩타이드 de novo 시퀀싱 서비스를 제공합니다. 바이오텍 팩은 Thermo사의 최신 Obitrap Fusion Lumos 질량 분석기를 사용하여 펩타이드 샘플의 서열 분석을 수행합니다. Obitrap Fusion Lumos 질량 분석기는 현재 가장 높은 해상도와 민감도를 자랑하는 질량 분석기로, 낮은 농도의 펩타이드 조각 식별 감도를 보장합니다. 또한 펩타이드 분해 과정에서 HCD와 ETD 모드를 결합하여 펩타이드 조각의 완전성을 보장합니다. 질량 스펙트럼 원시 데이터를 얻은 후, 30개 미만의 아미노산으로 구성된 펩타이드의 경우 데이터베이스 또는 de novo 시퀀싱 방법을 사용하여 원시 데이터를 분석합니다. 30개 이상의 아미노산으로 구성된 펩타이드는 일반적으로 de novo 시퀀싱 방법을 사용하여 펩타이드 서열을 유도합니다.
샘플 준비 권장 사항:
• 가능한 한 100 ug의 샘플을 준비: <30 aa의 샘플은 최소 10-25 ug의 샘플을 준비하고, >30 aa의 샘플은 가능하면 최소 50 ug 이상의 정제된 샘플을 준비합니다;
• 가능한 한 순수한 시약을 사용하고, 분자 생물학급 시약은 피하십시오;
• 가능한 한 작은 원심관을 사용하십시오;
• 오염원을 피하거나 용액 내에서 단백질을 농축하십시오.
**바이오텍 팩의 기술 전문가에게 문의하여 샘플 준비를 위한 맞춤형 지침을 받을 수 있습니다.
바이오텍 팩은 액체 및 고체 상태의 샘플에서 펩타이드 서열 분석을 제공할 수 있습니다. 고체 샘플은 아이스 팩으로 운송할 수 있으며, 용액 샘플은 진공 건조 또는 냉동 건조 후 아이스 팩으로 운송할 수 있으며, 드라이 아이스를 통해 샘플을 운송할 수도 있습니다. 전화로 문의해 주세요.
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