고처리량 유전자 결실 후 단백질체 분석
단백질체학은 생물체 내 모든 단백질의 구성, 구조, 기능 및 상호작용을 연구하는 과학 분야로, 그 목표는 포괄적인 단백질 목록을 작성하고 이들이 생명 과정에서 어떤 역할을 하는지 이해하는 것입니다. 그러나 현재 충분히 연구된 생물학적 기능을 가진 단백질은 여전히 적으며, 일부 단백질 코딩 유전자는 관련 주석이 없습니다. 비동의 일염기다형성과 선택적 스플라이싱 및 번역 후 수정 과정에서 생성되는 다양한 단백질 유형 또한 이 연구를 더 어렵게 만듭니다. 고처리량 유전자 제거 기술의 출현은 대규모 단백질 및 단백질 형태 검출에 강력한 도구를 제공합니다. 고처리량 유전자 제거 기술은 특정 유전자를 침묵시키거나 제거하여 단백질체의 변화를 관찰할 수 있으며, 고해상도 질량 분석 기술과 결합하여 단백질의 구성, 수정 및 상대적 풍부성을 분석하는 데 사용될 수 있습니다.
Dolgalev G,et al. Genes. 2021.
고처리량 유전자 제거 기술의 단백질체학 적용
고처리량 유전자 제거 기술과 단백질체학의 결합은 생물학 연구에 새로운 관점을 제공합니다. 이 두 기술을 결합함으로써 연구자들은 특정 유전자 제거가 단백질체에 미치는 영향을 연구하고, 제거된 유전자와 관련된 단백질을 식별하여 유전자와 단백질 간의 상호작용을 더 잘 이해하고, 단백질 조절 네트워크를 밝힐 수 있습니다. 예를 들어, 연구자들은 특정 유전자의 제거가 암세포의 단백질 발현에 어떻게 영향을 미치는지 확인하여 새로운 암 치료 방법을 찾을 수 있습니다. 또한, 이러한 결합은 신경퇴행성 질환, 면역 질환 및 대사 장애 등 다양한 질병의 메커니즘 연구에도 활용될 수 있습니다.
바이트크 바이오테크(BTP)는 고해상도 단백질체학 분석 플랫폼을 기반으로 고처리량 유전자 제거 기술을 결합하여 유전자 제거부터 단백질체 분석까지의 전체 솔루션을 제공합니다. 최적화된 CRISPR/Cas9 시스템을 통해 인간/마우스 세포주, 원발 세포, 면역 세포 및 iPS 세포의 단일/다중 유전자 제거, 프레임시프트 돌연변이 및 대규모 서열 제거가 가능합니다. KO 세포를 획득한 후 이를 배양하고 KO 세포가 발현하는 단백질을 추출하여 고해상도 질량 분석 플랫폼을 통해 단백질체를 분석하고, 단백질의 구성 및 수준을 식별하여 특정 제거 유전자가 단백질 수준에 미치는 영향을 설명하며, 유전자가 단백질을 조절하는 메커니즘을 밝힙니다. BTP는 자체적으로 7대의 검출 플랫폼을 구축하고 있으며, CNAS/ISO9001 이중 품질 시스템 인증 실험실을 보유하고 있어 최상의 연구 서비스를 제공합니다. 저희와의 협력을 기대하며, 더 많은 서비스 세부 정보를 무료로 문의해 주세요!
서비스 장점
1) 제거 효율 보장: 최적화된 CRISPR/Cas9 시스템으로, 80% 이상의 타깃 제거 효율이 70% 이상입니다. 유전자 제거 후, Sanger 시퀀싱과 심층 단백질체학 기술을 사용하여 제거 효율을 이중으로 검증하여 데이터의 진실성을 보장합니다.
2) 완벽한 단백질체학 분석 플랫폼: 우리의 단백질체학 분석 플랫폼은 완벽한 샘플 전처리 장비, 고특이성 단백질 수정 농축 플랫폼, 초고효율 액체 크로마토그래피 고해상도 질량 분석 연합 및 단백질 N말단 서열 분석기를 갖추고 있어 단백질체의 효율적 추출, 특정 수정 펩타이드의 효율적 농축 및 단백질의 규명, 상대 정량(3D & 4D) 및 절대 정량 분석을 실현하여 KO 세포가 발현하는 단백질체에 대한 포괄적인 분석을 수행할 수 있습니다.
3) 프로젝트 주기 단축유전자 제거 실험 전에, 우리는 다양한 세포에서 유전자 필수성 및 발현량을 분석하여 실험의 실행 가능성을 보장하고 실험 실패 위험을 줄입니다. 고객의 타깃을 위한 사전 실험을 통해 gRNA 검증을 진행할 필요가 없어 프로젝트 주기를 크게 단축했습니다.
4) 원스톱 서비스BTP는 풍부한 단백질체학 서비스 경험과 전문적인 기술 인력을 보유하고 있으며, 귀하의 요구에 따라 최적의 프로젝트 계획을 맞춤 제작할 수 있습니다. 실험 목적을 알려주고 샘플을 보내주시면 BTP가 모든 프로젝트 후속 작업을 담당합니다. 여기에는 샘플 처리, 실험 분석, 데이터 분석 및 프로젝트 보고서가 포함됩니다.
응용 분야
1.질병 메커니즘 연구
특정 유전자를 제거함으로써 연구자들은 질병 상태에서의 단백질 발현 및 조절 변화를 관찰할 수 있습니다. 예를 들어, 암 연구에서 암의 발전과 관련된 유전자를 제거하여 종양의 생물학적 메커니즘을 더 잘 이해할 수 있습니다.
2.약물 타겟 발견
유전자 제거가 단백질체에 미치는 영향을 분석하여 새로운 약물 타겟을 식별할 수 있습니다. 예를 들어, 알츠하이머병 치료제 개발 시 인지 기능 저하와 관련된 유전자를 제거하여 잠재적 치료 타겟을 찾을 수 있습니다.
3.기능 유전체학 연구
유전자 제거 기술과 단백질체학을 결합하여 세포 내 유전자와 단백질의 기능 및 이들이 생물학적 과정을 조절하는 방식을 연구합니다.
4.BiotechPack, 바이오의약품 특성 분석 및 멀티오믹스 질량분석(MS) 서비스 제공업체
시스템 생물학 분야에서 유전자 제거 기술과 단백질체학을 결합하여 단백질-단백질 상호작용 네트워크를 구축하고 복잡한 생물 시스템을 이해하는 데 도움을 줍니다. 예를 들어, 특정 병리 조건에서의 단백질체 변화 분석을 통해 질병 과정의 핵심 조절 네트워크를 밝혀냅니다.
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