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단세포 시퀀싱을 할 때, 조직을 원주 세포 배양한 후 일정량의 세포가 자란 다음에 검사를 보낼 수 있나요?

단일 세포 시퀀싱 실험에서는 원조직에서 직접 세포를 분리하는 것이 세포를 원세포 배양 후 검사하는 것보다 더 나은 선택입니다. 이는 세포 배양이 다음의 문제를 초래하여 단일 세포 시퀀싱 결과의 정확성과 신뢰성을 떨어뜨릴 수 있기 때문입니다.

  • 배양이 세포의 이질성 손실을 초래할 수 있습니다.
  • 배양 조건이 세포의 유전자 발현 프로필을 변화시킬 수 있습니다.
  • 오염 위험과 배경 소음을 증가시킵니다.

 

추천 처리 방법:

1. 조직에서 직접 단일 세포를 분리하는 것을 우선적으로 선택

(1) 효소 소화 또는 기계적 분리를 통해 단일 세포 현탁액을 얻습니다.

(2) 세포 상태 변화를 피하기 위해 즉시 시퀀싱을 진행합니다.

 

2. 특수한 경우 짧은 시간 동안 배양 가능

(1) 배양이 필요할 경우, 시간을 24-48시간으로 제한하고 배양 조건을 엄격히 최적화합니다.

(2) 배양 전후 샘플을 수집하여 유전자 발현 차이를 평가합니다.

 

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