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고처리량 유전자 결손 후 대사체 분석

대사체학은 세포 내 대사물질의 정량적 측정을 통해 생물학적 상태에 대한 독특한 시각을 제공합니다. 시스템 생물학의 중요한 분과로서 생체 내 모든 대사물질의 복합적인 집합을 분석하고 해석하는 데 전념하고 있습니다. 질량분석(MS)과 핵자기공명(NMR)과 같은 핵심 기술을 사용하여 다양한 조건에서 대사물질의 변화를 정확하게 측정하고 비교할 수 있으며, 이를 통해 질병 메커니즘과 물질 대사 경로를 심도 있게 이해할 수 있습니다. 특히 CRISPR-Cas9 시스템과 같은 고처량 유전자 제거 기술의 발전과 함께, 우리는 이제 유전자가 세포의 대사 과정에 어떻게 영향을 미치는지에 대해 더 세밀한 수준에서 탐구할 수 있습니다.

고처량 유전자 제거 기술은 다양한 세포 유형과 생물 모델에서 수백 또는 수천 개의 유전자를 동시에 제거할 수 있게 합니다. 이 기술을 통해 우리는 대량의 유전자 제거 세포주를 빠르게 구축할 수 있으며, 시스템 차원에서 유전자 기능과 유전자 네트워크를 분석할 수 있습니다. 대사체학 질량분석 기술과 결합하여, 연구자들은 특정 대사 관련 유전자를 제거한 후 세포나 조직 내 대사물질의 구성과 풍부도 변화를 분석하고, 특정 유전자가 대사 경로에 미치는 영향을 연구하여 유전체 수준에서 유전자가 세포 대사를 어떻게 조절하는지를 이해할 수 있습니다. 예를 들어, 특정 대사 관련 유전자를 제거한 후, 세포 내에서 특정 대사물질의 변화를 관찰할 수 있으며 이를 통해 이러한 유전자가 대사 경로에서의 역할을 드러낼 수 있습니다.

백태파크 바이오테크(BTP)는 고해상도 대사체학 분석 플랫폼과 고처량 유전자 제거 기술을 결합하여 유전자 제거에서 대사체 분석까지의 원스톱 솔루션을 제공합니다. 당사의 최적화된 CRISPR/Cas9 시스템은 인간/생쥐 세포주, 1차 세포, 면역 세포 및 iPS 세포의 단일/다중 유전자 제거, 프레임 시프트 변이 및 대규모 서열 제거를 실현할 수 있습니다. KO 세포를 얻은 후 배양하고, KO 세포에서 생성된 대사물을 추출하여 고해상도 액체질량분석 플랫폼(LC-MS, GC-MS) 및 핵자기공명 플랫폼을 활용하여 대사체 분석을 수행하고, 대사물질의 종류 및 수준 변화를 식별하여 특정 제거 유전자가 대사 네트워크에 미치는 영향을 밝힙니다. BTP는 7개의 자체 구축된 검사 플랫폼을 보유하고 있으며 CNAS/ISO9001 이중 품질 시스템 인증 실험실을 갖추고 있어 최상의 연구 서비스를 제공합니다. 협력을 기대하며, 무료로 저희에게 연락하여 더 많은 서비스 정보를 알아보세요!

서비스 장점

1）제거 효율 보장: 최적화된 CRISPR/Cas9 시스템은 80% 이상의 타겟 제거 효율이 70% 이상이며, 유전자 제거 후 Sanger 시퀀싱과 심층 단백질체학 기술을 통해 제거 효율을 이중으로 검증하여 데이터의 진실성을 이중으로 보장합니다.

2）완벽한대사체학 분석 플랫폼: 당사의 대사체학 분석 플랫폼은 완벽한 샘플 전처리 장비(세포 분쇄기, 조직 분쇄기, 조직 연마기 등)와 초고효율 액체 크로마토그래피 고해상도 질량분석(Orbitrap Exploris 240 & Orbitrap Exploris 480 With FAIMS Pro)으로 구성되어 있어 대사물질의 효율적인 추출, 정성 식별 및 상대 정량(3D & 4D), 절대 정량 분석을 실현할 수 있습니다.

3）프로젝트 주기 단축:유전자 제거 실험 전에, 우리는 다양한 세포에서 유전자의 필요성과 발현량을 분석하여 실험의 실행 가능성을 보장하고 실험 실패 위험을 줄입니다. 또한 고객의 타겟에 대한 사전 실험을 통한 gRNA 검증이 필요 없으므로 프로젝트 주기가 크게 단축됩니다.

4）원스톱 서비스:BTP는 풍부한 오믹스 서비스 경험과 전문적인 기술 인력을 보유하고 있으며, 고객의 요구에 따라 최적의 프로젝트 방안을 맞춤화할 수 있습니다. 고객은 실험 목적을 알려주시고 샘플을 보내주시면, BTP가 샘플 처리, 실험 분석, 데이터 분석 및 프로젝트 보고서 등 모든 프로젝트 후속 작업을 담당합니다.

응용 사례

수송체 OCTN1 (SLC22A4)은 독립적인 운송 단백질로, 그 생리적으로 중요한 기질은 여전히 확인되지 않았습니다. OCTN1의 생리적 기능을 연구하기 위해 연구진은 먼저 수송체OCTN1유전자 제거(octn1^-/-) 마우스를 구축한 후, 대사체 분석을 통해 체내 기질을 식별했습니다. 연구 결과,octn1^-/-마우스의 혈액 및 여러 기관에서 강력한 천연 항산화제인 구아닌이 부족한 것으로 나타났습니다. 이 연구는 OCTN1이 체내 및 장내 구아닌 노출을 유지하는 데 중요한 역할을 하며, 장 조직 손상을 예방하는 데 중요할 수 있으며, 염증성 장 질환의 진단에 대한 가능성을 제공합니다.