펩타이드 아미노산 서열을 기반으로 아미노산 조성 특성, 이펩타이드 조성 특성 및 가짜 아미노산 조성 특성을 계산하는 방법은 무엇인가요?

1. 아미노산 조성 (Amino Acid Composition, AAC)

1. 원리

20종의 표준 아미노산의 상대 빈도를 통계합니다.

 

2. 계산 공식

 

그림 1

 

2. 이펩타이드 조성 (Dipeptide Composition, DPC)

1. 원리

AA, AC, ..., YY의 모든 400가지 가능한 이펩타이드의 빈도를 통계하여 아미노산의 국부 순서 정보를 포착합니다.

 

2. 계산 공식

 

그림 2

 

3. 가상 아미노산 조성 (Pseudo Amino Acid Composition, PseAAC)

1. 원리

AAC를 기반으로 아미노산의 물리화학적 특성(예: 소수성, 극성, 측쇄 질량 등) 및 순서 관련 정보를 도입하며, 주로 머신러닝 모델링에 사용됩니다.

 

2. 기본 형태 (Type I)

 

그림 3

 

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