생명 정보 분석 FAQ 요약
• 고효율 액체 크로마토그래피에서 불용성 다당류인 한천이 물이나 염류 이동상에 용해되지 않아 막을 통과할 수 없는 문제를 어떻게 해결할 수 있을까요?
고효율 액체 크로마토그래피(HPLC)에서 불용성 다당류(예: 한천)의 분자량을 측정해야 하는 경우, 이러한 다당류가 물이나 일반 염류 이동상에 용해되지 않아 용해성과 막 통과의 문제가 발생할 수 있습니다. 이 문제를 해결하기 위한 방법으로 다음과 같은 전략을 고려할 수 있습니다: 1. 적절한 용매 시스템 선택 1) 온도를 높이기: 한천과 같은 불용성 다당류는 고온에서 용해도가 좋으므로, 샘플을 따뜻한 용매(예: 가열한 물 또는 완충 용액)에 용해시켜 용해도를 높일 수 있습니다. 실험에서는 일반적으로 약 60°C 이상의 온도에서 용해하는 것을 선택하지만, 용매가 샘플을 손상시키거나 분자 구조를 변경하지 않도록 주의해야 합니다. 2) 강한 용매 또는 혼합 용매 사용: 때때로 적절한 농도의 염, 요소, 글리세롤, 그리고 디메틸설폭사이드(DMSO)와 같은 유기 용매를 포함한 혼합 용액을 사용하여 한천과 같은 다당류가 용해되도록 도와줄 수 있습니다. 샘플에 화학적 분해나 분자 구조 변경을 초래하지 않는 용매를 선택하는 것이 중요합니다. 2. 보다 적합한 이동상 채택 1) 고분자량 및 불용성 다당류 샘플의 경우, 용해제를 포함하거나 고농도 염을 포함한 완충용액과 같은 전문 용매 시스템을 사용하는 것을 고려할 수 있습니다. 이는 다당류의 용해를 도울 뿐만 아니라 샘플과 HPLC 칼럼 간의 상호작용을 효과적으로 피할 수 있습니다. 2) 계면활성제(예: Tween, SDS)를 포함한 이동상을 사용할 수 있으며, 때때로 이러한 보조 용매가 다당류의 용해도를 높여 샘플이 막과 칼럼을 원활하게 통과하도록 도울 수 있습니다. 그러나 계면활성제는 HPLC 칼럼에 축적되어 칼럼 효율 저하나 기준선 노이즈 증가를 초래할 수 있습니다.
• 교차 결합제를 사용한 후 세포 용해 시 초음파로 세포를 파쇄할 수 있나요?
교차 결합제를 사용한 후 세포를 용해할 때, 초음파 파쇄는 하나의 용해 방법으로 사용할 수 있지만, 교차 결합제가 초음파 파쇄의 효과에 영향을 미칠 수 있으므로 주의가 필요합니다. 사용 권장 사항: 1. 초음파 강도: 교차 결합제를 사용한 후 초음파 파쇄를 할 때는 가능한 낮은 초음파 강도를 선택하고 시간을 최적화하는 것이 좋습니다. 강한 초음파는 교차 결합제의 분해를 초래하거나 비특이적 손상을 일으킬 수 있습니다. 2. 온도 제어: 초음파 파쇄 과정에서 온도가 상승할 수 있으므로 냉각 시스템(예: 얼음 욕조)을 사용하여 온도를 제어하고 열 손상을 줄이며 교차 결합 구조를 파괴하지 않도록 해야 합니다. 3. 용해 조건 최적화: 교차 결합제 처리 후 세포가 용해되기 어려운 경우 다른 용해 방법(예: 동결 분쇄, 효소 분해 등)을 사용하거나 초음파 파쇄와 병행하여 사용할 수 있습니다. 백타이파이크 바이오테크--생물 제품 특성화, 다수의 학생 생물질 스펙트럼 검사를 제공하는 우수 서비스 제공업체 관련 서비스: 교차 결합법 단백질 상호 작용 분석
• 펩타이드 아미노산 서열을 기반으로 아미노산 조성 특성, 이펩타이드 조성 특성 및 가짜 아미노산 조성 특성을 계산하는 방법은 무엇인가요?
1. 아미노산 조성(Amino Acid Composition, AAC) 1. 원리 서열에서 20종 표준 아미노산의 상대 빈도를 통계합니다. 2. 계산 공식 그림 1 2. 이펩타이드 조성(Dipeptide Composition, DPC) 1. 원리 모든 400종 가능한 이펩타이드(AA, AC, ..., YY)의 빈도를 통계하여 아미노산의 국소 순서 정보를 캡처합니다. 2. 계산 공식 그림 2 3. 가짜 아미노산 조성(Pseudo Amino Acid Composition, PseAAC) 1. 원리 AAC를 기반으로 아미노산의 물리화학적 성질(예: 소수성, 극성, 측쇄 질량 등)과 서열 순서 관련 정보를 도입하여 주로 머신러닝 모델링에 사용됩니다. 2. 기본 형태(Type I) 그림 3 바이타이파크 생명과학--생물 제품 특성화, 다수의 학생 생물질량 분석 고품질 서비스 제공업체 관련 서비스: 아미노산 조성 분석
• 단백질의 N-말단 플라스미드를 설계해야 하는데, N-말단 서열을 어떻게 찾아야 하나요?
단백질의 N-말단 서열을 찾으려면 일반적으로 다음 단계를 따르면 됩니다: 단백질의 전체 서열을 찾고, N-말단 서열을 확인하고, 신호 펩타이드 예측(필요한 경우), 참고 문헌이나 실험 데이터를 참조합니다. 첫째, 단백질의 전체 서열 찾기 1. 데이터베이스에서 관심 있는 단백질의 전체 서열을 찾습니다. 일반적으로 사용되는 단백질 데이터베이스에는 UniProt, NCBI Protein 및 PDB 등이 있습니다. 2. 단백질의 이름, 유전자 이름 또는 서열 번호(예: UniProt ID)를 입력하여 단백질의 전체 서열을 얻을 수 있습니다. 둘째, N-말단 서열 확인 1. 단백질 서열은 일반적으로 N-말단(첫 번째 아미노산 잔기)에서 시작됩니다. N-말단은 아미노산 사슬의 시작 부분으로, 일반적으로 서열의 처음 10~20개의 아미노산입니다. 2. 전체 서열을 가져온 후, 서열의 시작 부분, 즉 N-말단 서열을 직접 확인합니다. 셋째, 신호 펩타이드 예측(필요한 경우) 만약 단백질에 신호 펩타이드가 포함되어 있다면 N-말단의 신호 펩타이드 부분을 절단해야 할 수 있습니다. SignalP와 같은 온라인 도구를 사용하여 신호 펩타이드를 예측하고 제거 위치를 확인할 수 있습니다. 넷째, 참고 문헌 또는 실험 데이터 단백질이 번역된 후 가공 또는 수정(예: N-말단 단축 또는 수정)을 겪는 경우, 적절한 N-말단 서열을 사용하여 플라스미드를 설계할 수 있도록 구체적인 문헌이나 기존 실험 데이터를 참조해야 할 수 있습니다. 위의 방법을 통해 플라스미드 설계를 위한 정확한 N-말단 서열을 얻을 수 있습니다; 실험에 특정 수정이나 가공이 포함된다면 이러한 요인도 고려해야 합니다.
• 대변을 체외 발효할 때 -80°C에서 보관할 수 있나요?
대변은 -80°C에서 체외 발효를 위해 보관할 수 있지만, 보호제를 추가하고 가능한 한 빨리 사용하는 것이 좋습니다. 미생물 군집의 활성이 중요한 경우 신선한 샘플을 우선 사용하는 것이 좋습니다. 보관 및 해동할 때는 가급적 혐기성 조건을 유지하여 미생물 군집 손실을 줄여야 합니다.
• 유전자가 어떻게 동시에 여러 단백질을 전사하고 번역할 수 있나요?
유전자가 동시에 여러 가지 다른 단백질을 전사하고 번역하는 것은 주로 유전자 표현 조절 메커니즘에 의존하며, 여기에는 가변 스플라이싱, mRNA 편집, 리보솜 리딩 프레임 이동, 내부 리보솜 진입 부위(IRES), 다중 코돈 mRNA 등이 포함됩니다. 다음은 몇 가지 가능한 메커니즘입니다:
• 채혈 샘플을 채취한 후 평평하게 놓아도 되나요? 반드시 세워 놓아야 하나요?
채혈 샘플을 채취한 후 평평하게 놓아야 하는지 세워야 하는지는 샘플의 종류와 이후 분석의 요구 사항에 따라 다릅니다.
• miRNA는 생물 의학에서 어떤 실제적인 응용이 있습니까?
miRNA의 생물 의학적 응용은 주로 다음과 같습니다: 생물 마커로서 질병의 조기 진단 및 예후 평가에 사용; 약물 개발의 표적으로서 새로운 약물 설계를 촉진, 특히 항암 분야에서 진전을 이루었습니다; miRNA 발현 조절을 통해 심장병 및 신경퇴행성 질환 치료에 활용; 또한 miRNA는 유전자 치료의 발전을 촉진하여 보다 정밀한 개인 맞춤형 치료를 실현합니다.
• 나는 RAW 원시 데이터만 가지고 있는데, 어떤 소프트웨어로 처리해야 단백질 서열을 알 수 있을까요?
RAW 원시 데이터(예: 질량 분석기로 얻은 파일)에서 단백질 서열을 해석하려면 일반적으로 전문적인 질량 분석 데이터 분석 소프트웨어와 데이터베이스 검색 도구를 사용해야 합니다. 다음은 일반적으로 추천하는 소프트웨어입니다: 1. 일반적인 소프트웨어 도구 1. 원시 데이터 처리를 위한 도구 (1) Thermo Fisher Xcalibur/Proteome Discoverer Thermo Fisher의 질량 분석기를 위해 설계되었으며 RAW 데이터를 직접 읽을 수 있습니다. Proteome Discoverer는 데이터베이스 검색을 지원하고 단백질 식별 결과를 출력합니다. 다른 브랜드의 질량 분석기를 사용하는 경우, 데이터 변환을 위해 다른 특정 소프트웨어나 도구가 필요할 수 있습니다. (2) MSConvert (ProteoWizard) 무료 오픈 소스 도구로, RAW 파일을 mzML, mzXML 등의 표준 형식으로 변환할 수 있어 다른 소프트웨어에서 분석하기 편리합니다. 2. 데이터베이스 검색 및 단백질 식별을 위한 도구 (1) Mascot 상업적인 데이터베이스 검색 도구로, 다양한 질량 분석 데이터를 지원합니다. 사용할 때는 UniProt와 같은 참조 단백질 데이터베이스가 필요합니다. (2) MaxQuant 무료이며 강력한 질량 분석 데이터 분석 도구로, 단백질체 연구에 널리 사용됩니다. 내장된 Andromeda 검색 엔진을 포함하여 데이터베이스 검색 및 단백질 식별에 사용됩니다. 일반적인 변형 분석을 지원합니다.
• HPLC 샘플 농도 및 백분율 함량의 오차를 어떻게 분석할까요?
고효율 액체 크로마토그래피 (HPLC)에서 샘플 농도와 백분율 함량의 오차 분석은 실험 결과의 신뢰성을 보장하는 중요한 단계입니다. 다음은 자세한 오차 분석 단계와 방법입니다: 1. 이론적 오차 분석 1. 기기 오차 （1）유량 변동: HPLC 펌프의 유량이 불안정하면 유지 시간과 피크 면적에 직접적인 영향을 미쳐 농도 측정에 영향을 줄 수 있습니다. （2）검출기 감도 변화: 검출기 (예: 자외선 검출기)의 감도는 온도나 광원 강도의 변화로 인해 변동할 수 있습니다. （3）컬럼 온도 변동: 온도 변화는 분석 컬럼의 분리 효율에 영향을 미쳐 유지 시간과 피크 형태의 변화를 초래할 수 있습니다. 2. 방법 오차 （1）표준 곡선 오차: 표준 곡선의 적합이 좋지 않으면 샘플 농도 계산에 시스템 오차가 발생할 수 있습니다. （2）기준선 드리프트: 잡음과 기준선 드리프트는 피크 면적의 정확한 측정에 영향을 미칩니다. （3）샘플 준비 오차: 샘플 용액의 농도가 불균일하거나 부피 측정이 부정확하면 오차가 발생할 수 있습니다. 2. 실험 오차 분석 1. 시스템 오차 교정 및 검증을 통해 시스템 오차를 줄이고, 정기적으로 알려진 표준 물질을 사용하여 기기를 교정하고 방법 검증(예: 선형성, 반복성 및 회수율 실험)을 수행합니다. 2. 랜덤 오차 반복 실험을 통해 랜덤 오차를 평가하고, 동일한 배치의 샘플을 여러 번 측정하여 상대 표준 편차 (RSD)를 계산하여 정밀도를 평가합니다. 3. 데이터 처리 오차 분석 1. 데이터 적합 오차 적절한 수학 모델을 사용하여 표준 곡선을 적합시키고 과적합 또는 부족적합을 피합니다. 2. 피크 적분 오차 피크 시작점과 끝점......
How to order?
