비표지 단백질 정량화 기술(Label Free)은 액체 크로마토그래피와 질량 분석을 통해 단백질 분해 펩타이드를 분석하는 방법입니다. 비싼 안정 동위원소 표지를 내부 기준으로 사용할 필요가 없으며, 대규모 단백질 식별 시 생성된 질량 분석 데이터를 분석하여 서로 다른 샘플에서 상응하는 펩타이드 신호 강도를 비교함으로써 펩타이드에 해당하는 단백질을 상대적으로 정량화합니다.
기반SILAC및iTRAQ기반의 정량 단백질체학 연구 기술은 먼저 단백질을 표지한 후 질량 분석을 통해 분석합니다. 제공되는 단백질 정량 정보의 양이 방대하지만, 표지 시약은 비교적 비싸며 각 샘플의 비용이 큽니다. 따라서 전체 단백질 수준에서 단백질 발현 변화를 정량 분석하는 데 적합합니다. 상대적으로 간단한 단백질 혼합물, 예를 들어 co-IP 샘플의 경우, 투자 대비 수익률이 낮습니다. 특정 번역 후 수정 방식의 단백질체학 연구, 예를 들어 유비퀴틴화 연구의 경우, 유비퀴틴화는 라이신 측쇄에서 발생합니다. 유비퀴틴화 펩타이드의 농축은 라이신 측쇄에 남아 있는 두 개의 글리신(gly-gly)에 대한 항체를 이용하여 이루어지지만, iTRAQ 시약의 표지는 이 농축 과정에 큰 영향을 미칩니다. 따라서 iTRAQ 표지 기술을 사용하여 조직 샘플의 유비퀴틴화 수정을 단백질체 수준에서 분석할 수 없습니다. Label Free 정량 분석 기술은 이러한 실험 요구에 따라 개발된 정량 단백질체학 기술입니다. 동일한 펩타이드가 질량 분석 동안 이온화 효율이 동일하면 질량 스펙트럼 피크의 면적이 직접적으로 해당 펩타이드 양을 나타냅니다. 따라서 동일한 펩타이드 질량 스펙트럼 피크 면적을 비교하여 해당 펩타이드가 나타내는 단백질의 상대적 정량 정보를 직접 얻을 수 있습니다.
Biotech Packer는 Thermo Fisher의 Q ExactiveHF 질량 분석 플랫폼, Orbitrap Fusion 질량 분석 플랫폼, Orbitrap Fusion Lumos 질량 분석 플랫폼을 Nano-LC와 결합하여 Label Free 기반의 정량 단백질체 분석 서비스 패키지를 출시했습니다. 실험 목적을 알려주시고 세포를 보내주시면 이후 모든 프로젝트에 대해 저희가 책임집니다. 여기에는 세포 배양, 세포 표지, 단백질 추출, 단백질 절단, 펩타이드 분리, 질량 분석, 원시 데이터 분석, 생물정보학 분석이 포함됩니다.
Label Free 정량 단백질체학 분석 절차
Label Free 정량 단백질체학 서비스 절차
샘플에 관하여
1. co-IP 샘플을 제공하는 경우, 단백질 요구량은 약 2-5ug이며, 단백질 샘플을 보내실 때 세정제(예: SDS)나 높은 산소 농도가 포함되지 않도록 하십시오. 또는 단백질 샘플이 포함된 비드를 직접 보내주시면, 저희가 후속 실험을 책임집니다.
2. 조직 샘플을 제공하시는 경우, 드라이아이스를 사용하여 조직 샘플을 보내주십시오. 동물 샘플은 200mg 이상, 혈액 샘플은 최소 1ml(혈장은 EDTA를 사용하여 응고 방지), 혈청은 0.2-0.5ml, 소변은 2ml, 식물 샘플은 최소 1g, 세포 샘플은 1X10^7개 세포, 효모, 미생물 등은 건조 중량 200mg입니다.
3. 단백질 샘플을 제공하시는 경우, 단백질 총량이 50ug 이상이어야 합니다. 단백질 추출 시 일반적인 조직, 세포 용해액을 사용하십시오.
4. 샘플 운송: 충분한 드라이아이스를 사용하여 운송하고, 가능한 한 빠른 배송 방법을 선택하여 운송 중 샘플이 분해될 가능성을 줄이십시오.
중/영문 프로젝트 보고서
기술 보고서에서, Biotech Packer는 자세한 중영문 이중 언어 기술 보고서를 제공합니다. 보고서는 다음을 포함합니다:
1. 실험 단계 (중영문)
2. 관련 질량 분석 매개변수 (중영문)
3. 질량 분석 이미지
4. 원시 데이터
5. 단백질 차별 분석
6. 생물정보학 분석
Label Free 정량 단백질체학 원스톱 서비스
주문 및 샘플 발송만 하세요
Biotech Packer 원스톱 서비스 완료: 샘플 처리 - 기기 분석 - 데이터 분석 - 프로젝트 보고서
