SWATH(Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ions)은 ETH Zürich의 Dr. Ruedi Aebersold 팀과 AB SCIEX가 공동으로 개발한 획기적인 질량 분석 기술입니다. SWATH는 DIA(Data Independent Acquisition) 기술로, 전체 질량 분석 범위를 여러 작은 창으로 나누어 각 창의 모든 이온을 연속적으로 파쇄하여 모든 펩타이드 이온을 고속 1차 MS 스캔 후 2차 MS/MS 분석을 가능하게 합니다. 따라서 SWATH는 복잡한 샘플 내 거의 모든 검출 가능한 분자를 정량적으로 측정할 수 있습니다. SWATH는 shotgun proteomics의 고처리량 검출과 정밀 정량 분석의 장점을 결합하여 진정한 의미의 전경 질량 분석 수단인 MS/MS ALL을 제공합니다. 바이오텍 팍크는 AB SCIEX Triple-TOF 5600 plus 고해상도 질량 분석 시스템을 사용하여 빠른 스캔 속도와 4중극 질량 분석 시스템의 정량 민감도 능력을 갖춘 SWATH 정량 단백질 분석 서비스 패키지를 제공합니다. 귀하의 샘플을 보내주시면, 우리는 단백질 추출, 단백질 소화, 펩타이드 분리, 질량 분석, 원시 데이터 분석, 생물 정보학 분석 등 프로젝트의 모든 후속 작업을 수행할 것입니다.
SWATH 정량 단백질체학 서비스 기술 플랫폼
SWATH 정량 단백질체학 서비스 기술 플랫폼
SWATH 기술 특성
• 복잡한 샘플 내 모든 분자 정량화, 저농도 단백질 및 펩타이드 포함
• 높은 정량 정확도: 정량 정확도가 MRM 기술과 동등함
• 높은 처리량: 실험 한 번에 2000종 이상의 단백질 정량 검출 가능
• 완전하고 포괄적인 정보 저장, MS, MS/MS 각 피크의 데이터 저장 가능, 동일 샘플의 반복 검출 불필요
• MRM 기술과 달리 사전에 샘플 측정 방법을 조정할 필요 없음
SWATH/DIA의 장점 소개
복잡한 샘플 정량 분석의 주요 문제는 주로 샘플 자체의 고농도 단백질 간섭으로 인해 저농도 단백질을 식별하기 어렵다는 것입니다. 많은 DDA(Data Dependent Acquisition) 질량 분석 식별 방법은 MS 수준에서 펩타이드를 식별하고 MS 신호가 강한 펩타이드를 우선적으로 선택하여 2차 파쇄를 수행하므로 저농도 펩타이드는 2차 분석에 선택되기 어렵습니다. 그러나 SWATH/DIA는 샘플의 모든 분자를 차별 없이 분석하고 한 번에 모든 펩타이드의 MS, MS/MS 데이터를 저장하여 중요한 데이터를 놓치지 않도록 합니다. 총체적으로 SWATH는 정량 분석의 신뢰성을 크게 향상시키고, 복잡한 샘플 내 극저농도 단백질 분자의 고효율 측정을 가능하게 합니다.
DDA와 SWATH/DIA 질량 분석의 비교
또한, 비교하면MRM검출하려는 목표 분자에 따라 검출 방법을 최적화해야 하는 반면, SWATH는 모든 분자를 편견 없이 분석하며, 검출 방법을 사전에 최적화할 필요가 없고 이미 얻은 데이터에 기반하여 분석 방법을 최적화하면 됩니다. 따라서 SWATH 분석은 귀하의 검출 분석 주기를 크게 단축할 수 있습니다.
SWATH 정량 단백질체학 서비스 샘플 요구 사항
SWATH 정량 단백질체학 서비스 샘플 요구 사항
생물 정보학 분석
• SWATH 스펙트럼 분석, 단백질 데이터 품질 평가
• 다중 구성 샘플 PCA 분석
• 식별된 단백질 기능 주석: GO 기능 주석, KEGG 기능 주석 및 COG 기능 주석
• 차등 발현 단백질 통계 분석: Venn 다이어그램, 화산 다이어그램(Volcano Plot)
• 차등 발현 단백질 클러스터링 분석: 계층적 클러스터링, K-평균 클러스터링
• 차등 단백질 상호작용 분석: STRING 데이터베이스 기반 단백질 상호작용 네트워크 분석
중/영문 프로젝트 보고서
최종 기술 보고서에서 바이오텍 팍크는 귀하에게 상세한 중/영문 이중 언어 기술 보고서를 제공하며, 보고서에는 다음이 포함됩니다:
1. 실험 단계(중/영문)
2. 관련 질량 분석 매개변수(중/영문)
3. 질량 분석 이미지
4. 원시 데이터
5. 단백질 차등 수준 분석
6. 생물 정보학 분석
