미지 단백질 측정
단백질의 아미노산 서열은 단백질 구조와 기능을 결정하는 기초이며, 단백질 시퀀싱은 구성 단백질의 아미노산 종류와 배열 순서를 측정하는 것으로, 단백질체학 연구에서 중요한 내용입니다.일반적인 방법으로는 질량 분석법(예: 탠덤 질량 분석)과Edman분해법이 있습니다.미지의 단백질(unknown protein)은 아직 충분히 연구되고 설명되지 않은 단백질을 일반적으로 지칭합니다. 이러한 단백질은 새로 발견된 유전자에 의해 암호화되었거나, 알려진 생물체의 유전자 산물이지만 그 구조, 기능 및 역할이 완전히 이해되지 않은 것일 수 있습니다.미지의 단백질 시퀀싱생물체의 유전체 및 단백질체의 전모를 밝히는 데 도움이 됩니다,단백질 구조와 기능 연구, 생명공학, 약물 개발 및 질병 진단 등 분야의 발전을 촉진하는 데 중요한 의미를 가집니다.
바이타이파크 생명공학 BTP는 Thermo 회사에서 새로 출시한 Obitrap Exploris 240 질량 분석기를 기반으로 미지의 단백질 샘플의 시퀀스 분석을 구현하며, 일반적으로 사용되는 6종의 단백질 분해효소(Trypsin, Chymotrypsin, Asp-N, Glu-C, Lys-C 및 Lys-N)를 사용하여 각각 타겟 단백질을 분해하고 질량 분석을 수행하여 조각 펩타이드 조각을 얻는 동시에 펩타이드 조각 사이의 결합을 통해 단백질 시퀀스 100%를 측정합니다.
바이타이파크생명공학 BTP미지의 단백질 시퀀싱프로세스
1. 샘플 준비:
단백질을 추출하고 정제 과정을 통해 불순물을 제거합니다.
2. 단백질 등급화/분리:
단백질 샘플을 등급화하거나 분리하며, 일반적으로 1차원 또는 2차원 겔 전기영동(1D/2D-PAGE) 및 액체 크로마토그래피(예:HPLC) 등의 방법을 사용합니다.
3. 단백질 분해/소화:
다중 효소 소화(예:Trypsin, Chymotrypsin, Asp-N, Glu-C, Lys-C 및 Lys-N)를 통해 단백질을 더 작은 펩타이드 조각으로 분해하여후속 질량 분석을 용이하게 합니다.
4. 펩타이드 분리:
액체 크로마토그래피(예: 역상 고성능 액체 크로마토그래피,RP-HPLC)를 사용하여 단백질 분해 후 얻은 펩타이드를 추가로 분리합니다.
5. 질량 분석:
펩타이드를 질량 분석기를 통해 분석하여, 질량 분석 결과로 펩타이드의 질량, 전하 상태 등의 정보를 얻을 수 있습니다.
6. 펩타이드 시퀀싱:
탠덤 질량 분석(예:MS/MS)을 통해 펩타이드를 추가로 시퀀싱합니다.
7. 데이터 처리 및 분석:
Mascot, Sequest 등과 같은 전용 질량 분석 소프트웨어를 사용하여 알려진 단백질 데이터베이스와 질량 분석 데이터를 결합하여 분석 및 처리합니다.
미지의 단백질 시퀀싱 기술의 주요 응용
1. 새로운 단백질의 발견:
미지의 단백질을 시퀀싱하고 기능을 주석을 달아 새로운 생촉매, 신호 전달 단백질, 전사인자 등의 분자 기능을 발견할 수 있습니다.
2. 단백질 기능 연구:
단백질을 시퀀싱하여 기능 주석 및 단백질 상호작용 네트워크 연구에 데이터 지원을 제공합니다.
3.질병 바이오마커 발견:
병리 및 정상 조직 단백질체를 비교하여 잠재적 질병 바이오마커를 발견하여 질병 진단 및 치료에 단서를 제공합니다.
4. 약물 개발:
약물 작용의 타겟 단백질을 식별하는 데 사용하여새로운 약물 타겟을 발견하고,신약 개발 및 최적화를 가속화하는 데 도움이 됩니다.
샘플에 대해
다음 유형의 샘플을 수락합니다:
1.정제된 단백질: 순도 85% 이상의 단백질 샘플을 제공해 주시기 바라며, 제안된 샘플 양은 50-200ug이며 단백질 농도는 0.1-1mg/mL 사이여야 합니다.
2.단백질 추출물: 세포, 조직 또는 생물체에서 추출한 단백질 추출물을 포함하되 이에 국한되지 않습니다. 제안된 샘플 양은 200-500ug이며 단백질 농도는 1-5mg/mL 사이여야 합니다.
3. 단백질 젤 점/스트립: 1D-SDS PAGE로 분리된 단백질 젤 스트립, 2DE PAGE의 단백질 젤 점, IP, Co-IP 샘플 및 GST 융합 단백질 Pull-down 등의 정제 샘플 내의 단백질/단백질 혼합물. 젤 점/스트립의 경우 단백질 함량이 최소 10ng이고, 면역 침전 샘플의 경우 최소 20ug의 단백질을 제공해야 합니다.
중/영문 프로젝트 보고서
기술 보고서에서 바이타이파크는 귀하에게 상세한 중영문 이중 언어 기술 보고서를 제공하며, 보고서에는 다음이 포함됩니다:
1. 실험 단계(중영문)
2. 관련 질량 분석 매개변수(중영문)
3. 미지의 단백질 시퀀싱 세부정보
4. 질량 분석 이미지
5. 원시 데이터
미지의 단백질 시퀀싱 원스톱 서비스
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바이타이파크 원스톱 서비스 완료: 샘플 처리 - 기계 분석 - 데이터 분석 - 프로젝트 보고서
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