다중 펩타이드의 서열 분석에는 일반적으로 두 가지 방법이 있습니다: 데이터베이스 검색과 de novo 시퀀싱입니다. 데이터베이스 검색은 이미 알려진/제공된 데이터베이스에서 검색을 통해 펩타이드 서열을 식별하는 것입니다. 그러나 일부 생물 종의 데이터베이스가 부족하여 많은 새로운 또는 활성 펩타이드가 데이터에서 일치하지 않을 수 있습니다. 다중 펩타이드 de novo 시퀀싱은 이 문제를 해결할 수 있습니다. 다중 펩타이드 de novo 시퀀싱은 시퀀스 데이터베이스의 도움 없이 탄뎀 질량 분광법(MS/MS)을 활용하여 펩타이드의 아미노산 서열을 분석하는 과정입니다. 이 방법의 장점은 이론적 데이터베이스의 유무에 관계없이 새로운 또는 미지의 펩타이드에 대해 서열 분석을 수행할 수 있다는 점입니다.
de novo 시퀀싱의 기본 원리는 두 개의 프래그먼트 이온 사이의 질량 차이를 이용하여 펩타이드 체인의 아미노산 잔기의 질량을 계산하는 것입니다. 다중 펩타이드 de novo 시퀀싱 기술의 구현은 질량 분석 기술의 발전과 밀접한 관련이 있습니다. 최근 몇 년간 질량 분석의 질량 분해능이 몇 단계나 향상되었고, 특히 고정밀 질량 분석 성능의 현저한 향상은 다중 펩타이드 서열 분석에 강력한 기초를 제공했습니다.
다중 펩타이드 de novo 시퀀싱 고품질 스펙트럼 이론적 단편 이온 다이어그램
바이오테크놀로지 회사인 BGI는 Thermo의 최신 Obitrap Fusion Lumos 질량분석기와 Nano-LC 나노리터 크로마토그래피 기술을 결합하여 질량분석 기반의 다중 펩타이드 de novo 시퀀싱 서비스를 제공하여 펩타이드 서열을 분석합니다. BGI는 Thermo의 최신 Obitrap Fusion Lumos 질량분석기를 사용하여 펩타이드 샘플의 서열 분석을 구현하며, Obitrap Fusion Lumos 질량분석기는 현재 해상도 및 민감도가 가장 높은 질량분석기로, 낮은 농도의 펩타이드 단편의 민감도를 보장합니다. 또한, 펩타이드 단편화 과정에서 HCD와 ETD 결합 모드를 사용하여 펩타이드 단편의 완전성을 보장합니다. 질량분석 원본 데이터를 얻은 후, de novo 시퀀싱 방법을 사용하여 다중 펩타이드 서열을 유추합니다.
샘플 준비 권장 사항:
최대한 20 ug 이상의 샘플을 준비하세요. 용액과 건조 분말 모두 가능합니다. 용액 샘플의 경우, 버퍼에 고염, SDS 등의 계면활성제가 포함되어 있지 않도록 합니다.
**BGI의 기술 전문가와 상담하여 샘플 준비를 타겟팅합니다.
BGI는 액체 및 고체 상태의 샘플로부터 다중 펩타이드 서열 분석을 수행할 수 있습니다. 고체 샘플은 아이스팩으로 운송할 수 있으며, 용액 샘플은 진공 건조하거나 냉동 건조 후 아이스팩으로 운송할 수도 있고, 드라이아이스로 샘플을 운송할 수도 있습니다. 문의 바랍니다.
