백태파이크 바이오가 MALDI-TOF 질량분석 시스템과 LC-MS/MS 질량분석 시스템을 결합하여 전문적이고 정확한 단백질 겔점, 겔조각, IP 샘플, CO-IP 샘플 단백질 동정을 제공합니다. 동정 가능한 샘플은 1D-SDS PAGE로 분리된 단백질 겔조각, 2DE PAGE의 단백질 겔점, 단백질 발현 산물, 면역 공동 침전(Co-IP) 샘플을 포함합니다. 단백질 샘플의 동정 전 처리 과정은 Nature Methods에 발표된 '보편적 단백질체 분석 샘플 준비 방법'을 엄격히 따르며, 동정 실험에서 더 높은 펩타이드 커버리지를 보장합니다. 질량분석의 원리는 샷건법(Shot-gun)에 기반하며, 단백질 조각이나 단백질 용액을 효소로 절단하여 펩타이드 혼합물을 만들고, 고효율 액체 크로마토그래피로 분리하여 여러 간단한 성분으로 나눈 후 고해상도 질량분석기에 넣어 분석합니다. 검색 소프트웨어는 2차 질량분석 정보를 관련 데이터베이스와 비교하여 매칭 점수와 불일치 필터링을 결합하여 펩타이드의 정확한 서열을 얻고, 이를 통해 각 단백질의 전체 서열을 조립하여 단백질 동정을 실현합니다.
단백질 질량분석 동정 프로세스
샷건법(shot-gun) 기반 LC-MS 단백질 동정 프로세스
샘플에 대하여
1D SDS PAGE /2D PAGE 겔 샘플:
1. Coomassie Blue, SYPRO Ruby 및 Silver stain 샘플 모두 단백질 동정 실험을 진행할 수 있습니다.
2. 은염색 샘플은 후속 질량분석과 호환되지 않을 수 있으므로, 아래 제품 또는 실험 단계를 사용하여 은염색 실험을 진행하는 것을 추천합니다.
ProteoSilver Plus, Sigma (제품 번호 PROTSIL1 또는 PROTSIL2)
Dodeca Silver Stain, BioRad (제품 번호 161-0481 또는 161-0480)
3. 은염색 샘플은 탈색 처리를 하지 마세요.
액체 샘플(In solution format):
1. 샘플 내 단백질 양이 10ug 이상일 경우, 샘플의 버퍼 시스템에 대한 요구 사항은 없습니다.
2. 샘플 내 단백질 양이 10ug 미만일 경우, 샘플 준비 과정에서 SDS 등의 계면활성제 사용을 최소화하고 염의 농도를 낮추도록 주의하세요.
3. 샘플 제출 시, 샘플의 버퍼 시스템과 샘플 내 단백질의 예상 함량을 제공하는 것에 주의하세요.
Co-IP 샘플:
1. 엘루션 샘플이 겔로 이동해야 할 경우, 1D SDS PAGE 샘플 준비 요구 사항에 따라 준비하면 됩니다.
2. 엘루션 샘플을 직접 제출할 경우, HPH EB (0.5 M NH4OH, 0.5 mM EDTA) 버퍼 시스템을 사용하여 단백질을 엘루션하는 것을 추천하며, 엘루션 버퍼 시스템이 후속 질량분석 실험과 호환되도록 보장합니다.
샘플 운송:
1. 샘플을 동결 건조한 후 운송하는 것을 추천하며, 동결 건조 샘플 내 단백질은 매우 안정적입니다.
2. 액체 샘플은 드라이아이스로 운송하거나, 단거리 운송 시 아이스팩을 사용할 수 있습니다.
주의사항:질량분석을 이용한 단백질 샘플 동정 시, 샘플 준비 과정에서 장갑과 헤어캡을 착용하여 자신의 케라틴(keratin)으로 인한 샘플 오염을 최대한 피해야 합니다.
연구 사례
이 프로젝트는 중국과학원 생물물리학소의 한 교수님이 Co-IP 샘플을 보내주신 것으로 단백질 동정을 진행하였습니다. 얻어진 일부 결과는 아래 그림과 같습니다.
단백질 겔점, 겔조각, IP 샘플 단백질 동정 연구 사례
그림에서 알 수 있듯이, 우리가 제공한 결과 보고서에는 동정된 단백질의 Accession Number, Peptide coverage, 동정된 펩타이드 정보, 동정된 펩타이드의 수정 정보 및 동정된 단백질에 대한 상세 설명이 포함되어 있습니다.
중/영문 프로젝트 보고서:
기술 보고서에서, 백태파이크는 상세한 중영문 이중 언어 기술 보고서를 제공하며, 보고서에는 다음이 포함됩니다.
1. 실험 절차 (중영문)
2. 관련 질량분석 매개변수 (중영문)
3. 질량분석 이미지
4. 원데이터
5. 동정된 단백질의 상세 정보
단백질 겔점, 겔조각, IP 샘플 질량분석 동정 원스톱 서비스
주문 후 샘플 발송만 하시면 됩니다.
백태파이크 원스톱 서비스 완료: 샘플 처리 - 기기 분석 - 데이터 분석 - 프로젝트 보고서
