iTRAQ(등온 태그를 사용한 상대 절대 정량)와TMT(Tandem Mass Tags) 기술은 각각 미국의 AB Sciex와 Thermo Fisher에 의해 개발된 펩타이드 외부 표지 정량 기술입니다. 이 두 기술은 여러 개(2-10)의 안정된 동위원소 태그를 사용하여 펩타이드의 아미노 그룹을 특이적으로 표지하여 탠덤 질량 분석을 수행합니다. 이를 통해 최대 10개의 서로 다른 샘플 간의 단백질 상대 함량을 동시에 비교할 수 있으며, 다양한 병리 조건이나 다른 발달 단계에서의 조직 샘플 내 단백질 발현 수준의 차이를 연구하는 데 사용할 수 있습니다.
전달 가능한 세포 샘플의 경우, 우리는SILAC방법을 사용하여 세포 단백질체의 표지 과정을 완료할 수 있습니다. 그러나 조직 샘플이나 전달 배양이 불가능한 세포와 같은 많은 다른 연구 시스템의 경우, 다른 표지 방법이 정량적 단백질체 분석을 완료하는 데 필요합니다. TMT, iTRAQ 등 체외(in vitro) 표지 기반의 정량 방법이 탄생했습니다.
iTRAQ 태그는 아래 그림과 같은 세 부분으로 구성됩니다:
1. 보고 그룹(Reporter Group): 단백질 샘플의 풍부도 수준을 나타냅니다.
2. 평형 그룹(Balance Group): 보고 그룹의 질량 차이를 평형시켜 등중량 태그의 무게를 일치시켜, 동일한 펩타이드 절편의 m/z가 동일하도록 보장합니다.
3. 펩타이드 반응 그룹(Amine-specific Reactive Group): 펩타이드 절편의 N말단과 라이신 측쇄 아미노와 공유 결합을 형성하여 펩타이드 절편을 표지합니다.
iTRAQ와 TMT 태그 구조 도표
서로 다른 샘플의 동일한 펩타이드 절편은 TMT/iTRAQ 시약으로 표지된 후 동일한 질량을 가지며, 1차 질량 분석(MS1)에서 동일한 질량 스펙트럼 피크로 나타납니다. 이 질량 스펙트럼 피크가 선택되어 파쇄될 때, 2차 질량 분석(MS2)에서 서로 다른 보고 그룹이 방출됩니다. 이들이 각각의 질량 스펙트럼 피크의 신호 강도는 서로 다른 샘플에서 유래한 해당 펩타이드 절편과 그에 대응하는 단백질의 발현량의 높낮이를 나타냅니다. TMT/iTRAQ 정량 단백질체 연구는 높은 측정 정확성과 다양한 샘플 유형에 적합하여 현재 매우 광범위하게 사용됩니다. Baiteipike는 전통적인 TMT/iTRAQ 분석 기술을 기반으로 TMT/iTRAQ/MultiNotch MS 분석 기술을 제공하여 3차 파쇄 보고 이온을 사용하여 정량화의 정확성을 더욱 높일 수 있습니다.
Baiteipike는 Thermo Fisher의 Q ExactiveHF 질량 분석 플랫폼, Orbitrap Fusion Lumos 질량 분석 플랫폼과 Nano-LC를 결합하여 TMT/iTRAQ/MultiNotch MS 기반의 정량 단백질체 분석 서비스 기술 패키지를 제공합니다. 실험 목적을 알려주시고, 단백질을 보내주시면, 단백질 절단, 펩타이드 표지, 펩타이드 분리, 질량 분석, 질량 원시 데이터 분석, 생물 정보학 분석 등 프로젝트의 모든 후속 작업을 처리해드립니다.
iTRAQ/TMT 정량 단백질체 분석 실험 절차
iTRAQ 8-plex 정량 단백질체 분석 절차
iTRAQ/TMT 정량 단백질체 분석 기술 특징
• 고처리량 정량 단백질 분석: 10개의 샘플을 동시에 분석할 수 있습니다; 대량의 임상 샘플, 다수의 대조군 대규모 실험 분석에 적합하며, 새로운 생물 표지자를 발견할 수 있습니다.
• 체외 표지, 조직, 세포, 혈액 등 다양한 샘플 분석에 적합
• 질량 분석 감도가 높아 낮은 풍부도의 단백질도 검출 가능하며, 단백질 상대 풍부도의 광범위 비교가 가능합니다.
• 인산화 등 수정된 펩타이드 절편의 농축 방법과 결합하여, 번역 후 수정 변화에 대한 보다 정확한 연구가 가능합니다.
iTRAQ/TMT 정량 단백질체 분석 샘플 요구사항
TMT-iTRAQ-MultiNotch 정량 단백질체 분석 샘플 요구사항
주의: 샘플 운송 시 충분한 드라이아이스를 사용하고 빠른 배송 방식을 선택하여 운송 과정에서 샘플의 분해 가능성을 줄이십시오.
중/영문 프로젝트 보고서
기술 보고서에서 Baiteipike Biotechnology는 중영문 이중 언어 기술 보고서를 제공하며, 보고서에는 다음이 포함됩니다:
1. 실험 절차 (중영문)
2. 관련 질량 분석 매개변수 (중영문)
3. 질량 분석 이미지
4. 원시 데이터
5. 단백질 차이 수준 분석
6. 생물 정보학 분석
