SILAC와 면역 공침 질량 분석의 단백질 상호작용 분석

면역 공동 침전(Co-Immunoprecipitation, CoIP)은 특정 항체가 특정 항원을 인식하는 원리에 기반하여 단백질 상호작용을 연구하는 고전적인 방법입니다. 면역 공동 침전은 생리적 상태에서 단백질 간의 상호작용을 검증하는 데 주로 사용되며, 질량 분석(MS)과 결합하여 새로운 상호작용 단백질을 식별하고 발견하는 데 사용할 수 있습니다. 바이타이파크는SILAC방법을 사용하여 실험군과 대조군 세포를 각각 라벨링한 후 Co-IP 실험을 수행하며, 항원과 항체 간의 특이적 반응을 통해 면역 복합체를 분리합니다. 그런 다음 LC-MS/MS를 통해 면역 복합체 내의 단백질을 정성/정량적으로 분석합니다. 실험군과 대조군에서 특정 단백질의 함량이 통계적으로 유의미한 차이를 보일 때, 해당 단백질이 연구 중인 단백질과 상호작용한다고 판단합니다. 이는 단백질 상호작용의 거짓 양성 결과 가능성을 크게 줄여줍니다.SILAC기술과 Co-IP-MS 기술의 결합은 특정 상황에서 단백질 상호작용 네트워크를 고처리량으로 정량 분석하는 데 사용될 수 있습니다.
SILAC의 결합은 출처에서부터 품질의 차이를 도입하여 실험 시스템 오류를 줄이고, 정량 정보를 풍부하게 하며, 정확도를 높였습니다. 바이타이파크는 Thermo Fisher의 Q Exactive HF 질량 분석 플랫폼, Orbitrap Fusion 질량 분석 플랫폼, Orbitrap Fusion Lumos 질량 분석 플랫폼과 Nano-LC를 결합하여 SILAC와 면역 공동 침전 질량 분석의 단백질 상호작용 분석 서비스 패키지(SILAC-based CoIP-MS)를 제공합니다. 귀하의 실험 목적을 우리에게 알려주시고 세포를 보내주시면, 우리는 프로젝트의 모든 후속 작업을 책임질 것입니다. 여기에는 세포 배양, 세포 라벨링, 단백질 추출, 항체 IP, 효율성 테스트, 단백질 절단, 펩타이드 분리, 질량 분석, 질량 분석 원시 데이터 분석, 생물정보학 분석이 포함됩니다.

SILAC 기반 CoIP-MS 실험 절차

Chen, X. L. et al. Proteomics. 2015.

SILAC 기반 CoIP-MS 실험 절차

 

BTP-SILAC 기반 CoIP-MS 기술 특징과 장점

• 단백질 구조와 번역 후 수정을 최대한 보존합니다.
• 단백질 상호작용은 자연 상태에서 진행되므로 인위적인 영향을 피할 수 있습니다.
• 자연 상태의 상호작용 단백질 복합체를 분리할 수 있습니다.
• 고처리량으로 빠르고 완전하게 모든 상호작용 단백질을 분석할 수 있습니다.
• 대조군과 비교하여 비특이적 결합 단백질을 구별할 수 있으며, 거짓 양성이 낮습니다.
• 각 상호작용 단백질의 상대적 풍부함을 비교 분석할 수 있습니다.

SILAC 기반 CoIP-MS 실험 프로젝트 샘플 요구 사항

1. 귀하는 동결 보존된 세포를 드라이아이스로 보내주시기만 하면 되며, 세포는 5회 이상 계대 배양할 수 있는 능력을 보유해야 합니다.
2. 만약 스스로 세포를 라벨링하고 세포의 자극 등 처리 과정을 완료해야 한다면, 라벨링이 완료되고 처리된 세포 샘플 또는 단백질 샘플을 드라이아이스로 보내주시면 됩니다. 각 샘플에는 최소 300 ug의 총 단백질이 포함되어야 합니다.

주의:샘플 운송 시 충분한 드라이아이스를 사용하여 운송하고, 가능한 빠른 배송 방식을 선택하여 운송 중 샘플이 분해될 가능성을 줄이십시오.

중/영문 프로젝트 보고서

기술 보고서에서 바이타이파크는 귀하에게 상세한 중영문 이중 언어 기술 보고서를 제공하며, 보고서에는 다음이 포함됩니다.

1. 실험 단계 (중영문)
2. 관련 질량 분석 매개변수 (중영문)
3. 식별된 단백질의 상세 정보
4. 질량 분석 이미지
5. 원시 데이터
6. 생물정보학 분석

SILAC 기반 CoIP-MS 원스톱 서비스

귀하는 주문 후 샘플만 보내주시면 됩니다.
바이타이파크 원스톱 서비스는 샘플 처리 - 기기 분석 - 데이터 분석 - 프로젝트 보고서를 완성합니다.